После кончины Бориса Григорьевича Юсупова

Владельцами усадьбы в селе Спасское-Котово стали его вдова Ирина Михайловна, урожденная Зиновьева (1718–1788) и дети: лейб-гвардии Конного полка корнет Николай и княжны Елизавета, Александра, Анна и Авдотья. В экономических примечаниях Московской губернии за 1766–1770 годы в селе Спасское-Котово Воскресенского уезда значится «церковь каменная Спаса Нерукотворенного Образа, господский дом деревянный, сад с плодовитыми деревьями». В 1760 году по плану генерального межевания земель России было произведено межевание села Спасское-Котово и составлен его земельный план, сохранившийся в фонде Юсуповых, в РГАДА. Под церковью и кладбищем было занято девятьсот квадратных сажен земли (приблизительно 40 соток).

Сегодня по бывшему кладбищу села князей Юсуповых, поверх могил, проходит автодорога. От кладбища осталось несколько поднятых из-под земли памятников, которые теперь находятся во дворе храма.

По сведениям клировых ведомостей 1776 года, в селе числилось 33 приходских двора, в которых проживало 149 человек дворовых и крестьян мужского пола и 184 - женского пола. Церковной земли не было выделено, священник Илья Фёдоров и причт содержались на «ругу» (годичное содержание) от владелицы села И.М. Юсуповой и владельца соседнего имения Александра Ильича Касаткина, по всей вероятности, прихожанина церкви. Со второй половины XVIII века скромная усадебная церковь в селе Спасское-Котово постепенно превращется в родовую усыпальницу князей Юсуповых.

Устройство склепа И.М. Юсуповой и А.Б. Протасовой

В 1772 году в северном, Владимирском, приделе около левого клироса под полом устроли склеп, где была погребена умершая дочь князей Бориса Гигорьевича и Ирины Михайловны Юсуповых Анна Борисовна, в замужестве Протасова (1747-1772). В 1788 году рядом с А.Б. Протасовой была погребена скончавшаяся княгиня И.М. Юсупова. Над прахом обеих были положены каменные плиты с выбитыми надписями и поставлена мраморная урна. Каменные плиты сохранились до наших дней.